4 февраля 2022 года по поручению Президента РК был создан РГП на ПХВ «Центр поддержки цифрового правительства», который выступает методологическим и координационным (think tank) ядром для поддержки процессов проектного управления, реинжиниринга бизнес-процессов государственных органов, экспертизы проектов нормативных правовых актов на предмет «цифровизации».

Центр образован в результате реорганизации «Института прикладной математики», который был создан Постановлением Кабинета Министров Казахской ССР № 564 от 26 сентября 1991 года, в Караганде на базе отдела прикладной математики Института математики и механики АН КазССР.

Организатором и первым директором Института прикладной математики являлся член - корреспондент Национальной академии наук РК, профессор М.О. Отелбаев. В дальнейшем Институт возглавляли такие известные ученые математики, как профессора Т.Г. Мустафин, Х.Ж. Халманов, Е.С. Смаилов.

За время своего существования Институт прикладной математики испытал ряд трансформаций:

• В соответствии с постановлением Правительства РК от 10 декабря 2019 года № 914 Министерство цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности Республики Казахстан является уполномоченным органом РГКП «Институт прикладной математики».
• Постановлением Правительства РК от 15 ноября 2021 года № 815 РГКП «Институт прикладной математики» Министерства цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности Республики Казахстан был реорганизован путем преобразования в РГП на ПХВ «Институт прикладной математики» Министерства цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности Республики Казахстан.
• Согласно постановлению Правительства РК от 4 февраля 2022 года № 51 РГП на ПХВ «Институт прикладной математики» Министерства цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности РК был переименован в РГП на ПХВ «Центр поддержки цифрового правительства» Министерства цифрового развития, инноваций и аэрокосмической промышленности РК.
• Постановлением Правительства от 24 марта 2022 года № 157 Центр определен поставщиком услуг по реинжинирингу бизнес-процессов (G2C, G2B, G2G) для реализации программ цифровой трансформации.
• Постановлением Правительства РК от 25 мая 2022 года № 337 Центр определен “сервисным интегратором”.
• Постановлением Правительства РК от 29 сентября 2022 года № 765 Центр определен ответственным за организационное и методологическое сопровождение цифровой трансформации государственного управления